甘肅省深化醫藥衛生體制改革領導小組辦公室印發通知，部署2017年全省城鄉居民大病保險工作，其中明確，未經省級新農合臺傳輸的住院和門診報銷數據，大病保險將不予進行報銷。城鄉參保居民年內多次住院且累計超過起付標準的，按照多次住院的最高醫院級別以分段累進計算方式給予報銷。對在2017年1月1日以后住院的農村建檔立卡貧困人群，享受住院醫療費用大病保險報銷起付線降低至3000元優惠政策。
新農合的住院和門診報銷數據必須由各市、縣基本醫保經辦機構上傳省級新農合信息臺，未經省級新農合臺傳輸的住院和門診報銷數據，大病保險將不予進行報銷;城鎮居民醫保有信息臺的由基本醫保經辦機構將報銷數據錄入信息臺，沒有信息臺的由基本醫保經辦機構提供準確的住院和門診報銷憑證及個人基本診療信息、醫保卡等資料，每月交由承辦保險公司錄入大病保險報銷臺。
隨著全民醫保體系基本形成，整合城鄉居民醫療保險體制也被確定為既定方向。2013年3月召開的第十二屆全國人民代表大會第一次會議審議通過的國務院機構改革和職能轉變方案曾提出，職工醫保、城鎮居民醫保、新農合的職責要整合為由一個部門承擔，并明確整合工作要在當年的6月底前完成。
專家認為，城鄉醫保并軌完成后，不僅兩者在定點醫院范圍、用藥藥品目錄、診療項目目錄和服務設施目錄等方面可以實現資源共享，對參保人而言，門診病種有望增多，結算也將快捷省事。
兩年多來，各界對于醫保城鄉一體化的呼聲十分強烈。不過從全國范圍來看，醫保制度并軌任務進展緩慢，人社部經辦城鎮居民基本醫療保險、衛計委經辦新農合導致的醫保管理體制分割的局面未有明顯改觀，且在城鎮化過程中出現了一系列待遇失衡和制度銜接上的問題，重復參保、待遇重復享受、多頭報銷等現象依然存在。
“當前基本醫療保障制度間既有交叉又有斷裂，管理部門的分散也帶來了財政的重復投入和管理上的相互掣肘，存在著重復建設、信息不兼容的問題，管理層面也存在協調上的困難。”中央財經大學社會保障系主任褚福靈對《經濟參考報》記者表示，隨著我國城鄉一體化的快速發展，整合城鄉基本醫療保險制度的管理勢在必行。
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