廣東省共有43所二本批次招生的大學參與了2016廣東二本大學排名，其中排名第一的是深圳大學，排名第二的是廣東財經大學，排名第三的是廣東金融學院。
以下是廣東二本大學排名理科2016具體榜單，根據2015年理科二本錄取均分排名，包含部分專業在二本招生的一本大學。
| 廣東二本大學排名 | 學校名稱 | 錄取均分 |
| 1 | 深圳大學 | 584 |
| 2 | 廣東財經大學 | 580 |
| 3 | 廣東金融學院 | 574 |
| 4 | 廣州美術學院 | 574 |
| 5 | 廣東藥學院 | 567 |
| 6 | 廣東技術師范學院 | 564 |
| 7 | 廣東醫學院 | 562 |
| 8 | 東莞理工學院 | 559 |
| 9 | 仲愷農業工程學院 | 557 |
| 10 | 廣東警官學院 | 556 |
| 11 | 五邑大學 | 553 |
| 12 | 廣東第二師范學院 | 552 |
| 13 | 廣東海洋大學 | 551 |
| 14 | 惠州學院 | 549 |
| 15 | 北京師范大學珠海分校 | 546 |
| 16 | 佛山科學技術學院 | 546 |
| 17 | 肇慶學院 | 542 |
| 18 | 廣州航海學院 | 538 |
| 19 | 嶺南師范學院 | 538 |
| 20 | 廣州體育學院 | 537 |
| 21 | 韶關學院 | 535 |
| 22 | 嘉應學院 | 532 |
| 23 | 韓山師范學院 | 530 |
| 24 | 北京理工大學珠海學院 | 529 |
| 25 | 廣東石油化工學院 | 529 |
| 26 | 吉林大學珠海學院 | 527 |
| 27 | 廣東工業大學 | 520 |
| 28 | 廣東外語外貿大學南國商學院 | 518 |
| 29 | 華南理工大學廣州學院 | 516 |
| 30 | 電子科技大學中山學院 | 511 |
| 31 | 中山大學南方學院 | 510 |
| 32 | 廣東工業大學華立學院 | 509 |
| 33 | 廣東財經大學華商學院 | 507 |
| 34 | 中山大學新華學院 | 505 |
| 35 | 廣東培正學院 | 501 |
| 36 | 廣州大學華軟軟件學院 | 500 |
| 37 | 廣州大學松田學院 | 500 |
| 38 | 東莞理工學院城市學院 | 498 |
| 39 | 廣州商學院 | 497 |
| 40 | 廣東白云學院 | 496 |
| 41 | 華南農業大學珠江學院 | 493 |
| 42 | 廣東技術師范學院天河學院 | 492 |
| 43 | 廣東東軟學院 | 485 |
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